Sejalan dengan visi tersebut maka Misi STIBANKS Al Ma'soem adalah:
- Melaksanakan pendidikan dan pengajaran untuk menghasilkan tenaga ahli dalam bidang Perbankan Syari’ah yang profesional dan menguasai teknologi informasi;
- Melakukan pembinaan untuk membentuk tenaga perbankan syari’ah yang berkarakter islami;
- Memajukan Perbankan Syari’ah sebagai institusi akademik yang terkemuka;
- Melakukan penelitian, pengkajian dalam bidang Perbankan Syari’ah;
- Melakukan kegiatan pengabdian kepada masyarakat sebagai bentuk layanan dan pengamalan keilmuan di masyarakat;
- Membangun kerjasama dengan lembaga IEC (Intensive English Course);
- Membangun kerjasama dengan lembaga/ institusi dan organisasi yang berkaitan dengan bidang Perbankan Syari’ah.